现在,研发下一代疗法的制药和生物学研究人员可以用 NVIDIA BioNeMo 新增的生成式 AI 工具包以及全新方法来获取其模型。
全新 BioNeMo 基础模型可以分析 DNA 序列、预测由药物分子引起的蛋白质形态改变,以及根据 RNA 确定细胞功能。
这些模型可用于加速蛋白质结构预测、生成化学和分子对接预测,现已通过 NVIDIA NIM 以微服务形式提供。NVIDIA NIM 是 NVIDIA 在本次 GTC 上推出的一组推理模型,可通过 NVIDIA AI Enterprise 软件平台获得。
不久,BioNeMo 模型也将在 AWS HealthOmics 上提供,这是一项专用服务,旨在帮助医疗健康和生命科学组织存储、查询和分析包括 DNA 和 RNA 在内的生物数据。
BioNeMo 新增的这些基础模型包括其初次推出的基因组学模型 DNABERT。该模型基于 DNA 序列进行训练,可用于预测基因组特定区域的功能、分析基因突变和变异的影响等。
BioNeMo 中即将提供的第二个模型是 scBERT,该模型基于单细胞 RNA 测序数据进行训练,用户能够将其应用于下游任务,例如预测基因敲除(删除特定基因或使其失活)的影响或识别细胞类型(如神经细胞、血细胞或肌肉细胞)。
BioNeMo 中新增的第三个模型是 EquiDock,它可以预测两种蛋白质相互作用过程的 3D 结构,这对了解药物分子是否有效至关重要。
NIM 的容器化 AI 微服务目录包含超过二十多个医疗健康模型。其中包括 DiffDock 和 ESMFold,前者可以预测潜在候选药物及其候选蛋白质的 3D 结构,后者可以基于单个氨基酸序列预测蛋白质结构。
NVIDIA BioNeMo 已得到全球 100 多家公司的采用,其中包括:
Astellas Pharma:这家总部位于东京的公司使用 BioNeMo 来加速药物研发应用的分子模拟和大型语言模型。该公司将使用 Tokyo-1 AI 超级计算机进一步推进其工作。
Cadence:总部位于加利福尼亚州圣何塞的 Cadence 是一家领先的计算软件开发商,该公司正在将 BioNeMo 微服务与其 Orion 平台集成,以加速分子模拟。
Iambic:这家总部位于圣迭戈的药物研发公司已经采用 BioNeMo,并会将其 NeuralPLexer 模型作为 BioNeMo Cloud API(应用编程接口)用于非商业用途,帮助研究人员预测蛋白质的 3D 结构会因药物分子产生怎样的变化。
Insilico Medicine:总部位于纽约的 Insilico 是 NVIDIA 初创加速计划的高级会员,该公司已将 BioNeMo 集成到其 AI 加速药物研发工作流中,开发了 30 多种治疗性药物,其中六种处于临床阶段。
Recursion:这家位于盐湖城的药物研发公司是托管合作伙伴,通过 BioNeMo 提供其 Phenom-Beta AI 模型。该 Transformer 模型可从细胞显微镜图像中获取洞察,从而帮助研究人员更好地了解细胞功能。
Terray Therapeutics:这家位于南加州的生物科技公司使用 BioNeMo 来帮助开发多靶点结构化绑定模型,并在 NVIDIA DGX Cloud上训练用于小分子设计的生成式 AI 模型。
ZENTEK信弘
上海信弘智能科技有限公司(ZENTEK)是 NVIDIA 核心合作伙伴。我们提供 NVIDIA 最新的软硬件产品与解决方案,为人工智能,数字孪生等领域的客户需求提供专业的服务。